scverse/spatialdata

何を解決するか

SpatialDataは、空間オミクスデータを扱うためのユニバーサルなフレームワークを提供します。生物学的情報と空間座標を組み合わせた単モーダルおよびマルチモーダルデータセットを管理する課題に対処し、異なるソフトウェアライブラリやプログラミング言語間で一貫した処理・分析が可能になるようにします。

仕組み

これは、データフレームワーク、スキーマ、シリアル化形式の統合されたものとして機能します。ストレージ形式はOME-NGFF仕様に基づいて構築されており、パフォーマンスの高いアクセスと操作を可能にします。エコシステムには、データの読み込み（spatialdata-io）、静的プロット（spatialdata-plot）、およびnapariプラグインによるインタラクティブな探索をサポートする専用ライブラリが含まれます。

対象ユーザー

Python、R、JavaScriptで複雑な生物学的データセットを標準化された方法で保存・操作・分析したい、空間オミクスデータを扱う研究者および開発者。

特徴

• 空間オミクス用のユニバーサルなスキーマとシリアル化形式。
• マルチモーダルデータのサポート。
• Python、R、JavaScriptでの実装によるクロス言語互換性。
• 効率的なデータストレージのためのOME-NGFF仕様との統合。