scverse/spatialdata

何を解決するか

空間オミクスデータのユニモーダルおよびマルチモーダルデータセットを処理・分析するためのユニバーサルなフレームワーク、スキーマ、およびシリアル化形式を提供し、研究者が異なるソフトウェアライブラリや言語間で複雑な生物学的データを処理・分析できるようにします。

仕組み

SpatialDataは、OME-NGFF仕様の上に構築されたコアデータフレームワークです。空間オミクスデータを格納およびシリアル化する標準化された方法を確立し、Python、R、JavaScriptで実装されたデータ読み込み（spatialdata-io）、静的プロット（spatialdata-plot）、インタラクティブな探索（napari-spatialdata）をサポートするエコシステムライブラリのセットが提供されます。

対象ユーザー

マルチモーダル生物学的データセットを一貫した方法で整理・操作・分析したい、空間オミクスデータを扱う科学者や開発者。

特徴

• 空間オミクス用のユニバーサルなスキーマとシリアル化形式。
• Python、R、JavaScriptを含む多言語対応。
• OME-NGFF仕様との統合。
• インタラクティブな探索とデータ読み込みのための専用ツールを備えた scverse エコシステムの一部。