scverse/anndata
Annotated data.
何を解決するか
anndataは、注釈付きデータ行列を扱うための標準化された方法を提供し、pandasとxarrayの間のギャップを埋めます。研究者が大規模なデータセット(単細胞オミクス解析で使用されるものも含む)をメモリ内またはディスク上ですべて効率的に管理できるようにします。
動作方法
このパッケージは、注釈付き行列をサポートするデータ構造を実装しています。スパースデータと遅延操作(lazy operations)のサポートを含む、計算的に効率的な操作を特徴としています。これにより、すべてのデータを一度にメモリに読み込まずに、大規模なデータセットを効率的に処理できます。
対象ユーザー
主にデータサイエンティストや研究者向けに設計されており、特に単細胞オミクスデータ(Scanpy用に当初開発されたため)を扱う人向けですが、注釈付きデータ行列を必要とするあらゆる用途に適しています。
特徴
- 注釈付き行列専用の独自データ構造
- メモリ使用量を削減するためのスパースデータサポート
- 効率的な処理のための遅延操作
- メモリ内およびディスクバックアップデータセットとの互換性
- scverseエコシステムとの統合
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