dptech-corp/Uni-Dock

何を解決するか

Uni-Dock は、従来の CPU ベースの分子ドッキングプログラムの遅い処理速度を克服し、創薬における大規模仮想スクリーニングのボトルネックを解消します。

動作方法

GPU で加速された分子ドッキングプログラムであり、GPU ハードウェアを活用して計算を実行します。vina、vinardo、ad4 などの複数のスコアリング関数をサポートしており、分子がターゲットに結合する様子を高い精度で予測できます。

対象ユーザー

大規模な仮想スクリーニングを効率的に行う必要がある計算化学および創薬分野の研究者や科学者。

特徴

• V100 GPU 上で単一コア CPU の AutoDock Vina と比較して 2000 倍以上の高速化を実現する GPU 加速性能。
• 複数のスコアリング関数（vina、vinardo、ad4）をサポート。
• 仮想スクリーニングワークフローを簡素化するための入出力管理を可能にする Uni-Dock Tools（Python パッケージ）を含む。
• パフォーマンスおよび精度評価のための標準化されたベンチマークスイートを備える。