ClawBio/ClawBio

What it solves

ClawBio は、AI エージェントを用いてバイオインフォマティクスワークフローを実行するための標準化かつ再現可能な方法を提供します。LLM が古いガイドラインや誤った遺伝子分類を「幻覚」するような「確率的」な AI 生成コードの問題を、バージョン管理された仕様制約付きの「スキル」ライブラリに置き換えることで解決します。これにより、ドメイン専門知識が正確かつ再現可能に実行されます。

How it works

ClawBio は「仕様優先」アーキテクチャを実装しています。LLM にパイプラインを即興で組ませるのではなく、自己完結型スキルのライブラリを使用します。各スキルは宣言的仕様（SKILL.md）、検証済み Python コード、デモデータで構成されます。エージェント（Claude や ChatGPT など）がスキルを呼び出すと、トレーニングデータから即興で生成するのではなく、専門家が定義した契約に従います。科学的厳密さを確保するため、プロジェクトには真実ベンチマーク、オフラインテスト用のモック API サーバー、実行ごとの再現性バンドル（コマンド、環境スナップショット、チェックサムを含む）を備えた検証インフラが含まれています。

Who it’s for

バイオインフォマティシャン、遺伝研究者、臨床医など、複雑なゲノム解析（例：薬理ゲノムプロファイリング、GWAS ルックアップ、バリアント注釈）を行い、結果が再現可能で最新の科学的ガイドラインに基づくことを保証したい方を対象としています。

Highlights

• Extensive Skill Library: 個人ゲノミクス（例：PharmGx Reporter）、集団遺伝学（例：GWAS Lookup、Ancestry PCA）、臨床レポートなど、94 のスキルを網羅。
• Local-first Privacy: ゲノムデータはデフォルトでユーザーのローカルマシン上で解析され、プライバシーが保護されます。
• Reproducibility Bundles: シェルコマンドや環境スナップショットを含む再生メタデータをエクスポートし、元の AI セッションがなくても実行を再検証可能にします。
• Agent-Agnostic: ロジックがモデルウェイトから分離されているため、Claude、ChatGPT、Ollama など異なる LLM でも動作します。
• Integrated Benchmarking: アルツハイマー病などの疾患に対する真実データを用いた体系的な検証スイートを提供し、遺伝子回収率と精度を評価します。