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HMMER: biological sequence analysis using profile HMMs
解決的問題
提供一種方法，可使用單一序列或多重序列比對作為查詢，在生物序列資料庫中搜尋同源序列。
工作原理
它實作了稱為「譜隱馬可夫模型」（profile HMM）的技術來執行這些搜尋。
適用對象
專為從事蛋白質家族域資料庫與大規模註釋流程的研究人員與開發者設計。
主要亮點
- 使用譜隱馬可夫模型（profile HMM）。
- 支援基於單一序列或多重序列比對的查詢。
- 已整合至多個蛋白質家族域資料庫與 InterPro 聯盟中。
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