10XGenomics/cellranger
10x Genomics Single Cell Analysis
解決的問題
提供一種標準化的方式，處理來自 10x Genomics Chromium 單細胞平台的原始資料，將原始定序讀數轉換為可用的生物資料，例如基因計數和轉錄本序列。
作法
使用一組分析管道執行多項關鍵任務：樣本去多重化、條碼處理，以及單細胞 3' 和 5' 表達的基因計數。同時也支援 V(D)J 轉錄本序列組裝與註解，以及 Feature Barcode 分析。
適用對象
使用 10x Genomics Chromium 平台產生的單細胞定序資料的研究人員與科學家。
主要特色
- 單細胞基因計數的標準化管道
- 支援 V(D)J 轉錄本序列組裝
- 支援 Feature Barcode 分析
- 支援 3' 與 5' 基因計數
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