scverse/rapids-singlecell

解决的问题

通过将常见的分析工作流从 CPU 迁移到 GPU，解决了大规模单细胞数据集分析中的性能瓶颈，显著加快了计算速度。

工作原理

该库采用以 AnnData 为先的 API，并利用 CuPy 和 NVIDIA RAPIDS 在 GPU 上执行计算。其设计与 Scanpy API 兼容度极高，用户无需大幅修改代码即可将工作流迁移到 GPU 加速。

适用人群

需要更高效处理大规模数据集的单细胞分析研究人员和数据科学家。

主要亮点

• GPU 加速：使用 AnnData 加速常见的单细胞工作流。
• 生态兼容性：与 Scanpy、Squidpy、decoupler 和 pertpy 集成并保持兼容。
• 安装简便：可通过 PyPI 和 Conda 安装。