maabuu/posebusters

Plausibility checks for generated molecule poses.

解决的问题

PoseBusters 提供了一种验证生成分子构象(如由基于 AI 的对接方法生成的构象)是否物理上合理的方法。它解决了 AI 模型可能生成看似正确但物理上无效的构象的问题,从而无法推广到新序列。

工作原理

该工具对以 SDF 格式提供的分子构象执行合理性检查。它可以评估单个分子,将预测的构象与真实晶体结构进行比较,或检查为特定蛋白质(PDB 格式)生成的配体。

适用人群

需要验证配体预测三维结构的计算化学家和从事分子对接及基于 AI 的药物发现的研究人员。

主要亮点

  • 生成分子构象的合理性检查。
  • 支持单个分子、蛋白质-配体复合物以及重新对接的配体检查。
  • 基于 CSV 文件的命令行界面,支持批量处理。
  • 基于发表在 Chemical Science 上的研究。

相关

  • 项目
  • 项目
  • 项目
  • 项目