Boom5426/Awesome-Virtual-Cell

解决的问题

虚拟细胞科学的研究人员面临快速增长且分散的文献。该项目将最相关的论文、数据集、基准测试和社区资源收集到一个有组织的场所，并提供精选的阅读路径，帮助新手避免迷失方向。

工作原理

该仓库是一个“awesome 列表”——一个手工精选的链接和摘要集合。资源按研究主题（虚拟细胞、基础模型、扰动建模、多模态与空间、干预设计、评估与测量）进行标记，并按年份排序。每个条目包括论文标题、发表场所或预印本服务器、主题标签，以及论文和代码的链接（如有）。一个特别的“从这里开始”部分为六个常见目标推荐了推荐的切入点，因此用户可以选择一条路径，而不是阅读所有内容。该项目还提供了一个交互式、可搜索的在线目录和研究景观图。

适用人群

计算生物学家、AI 研究人员、研究生和从业者，他们希望进入虚拟细胞领域或保持最新状态，而无需手动浏览数百篇论文和仓库。

亮点

• 396 篇论文按年份组织，支持按主题进行多标签过滤
• 精选的“从这里开始”路径，为每个目标指出最有用的阅读材料
• 可搜索的在线目录和交互式研究景观
• 涵盖关键方向：扰动预测、细胞基础模型、世界模型、多模态与空间分析、干预设计和评估
• 包括数据集、基准测试和社区挑战的链接