scverse/spatialdata

해결하는 문제

일변도 및 다변도 공간 오믹스 데이터셋을 처리하고 분석하기 위한 유니버설한 프레임워크, 스키마, 및 직렬화 형식을 제공하여 연구자들이 다양한 소프트웨어 라이브러리와 언어 간에 복잡한 생물학적 데이터를 처리하고 분석할 수 있도록 합니다.

작동 방식

SpatialData는 OME-NGFF 사양 위에 구축된 핵심 데이터 프레임워크입니다. 공간 오믹스 데이터를 저장하고 직렬화하는 표준화된 방법을 제시하며, Python, R, JavaScript로 구현된 데이터 로딩(spatialdata-io), 정적 플롯(spatialdata-plot), 인터랙티브 탐색(napari-spatialdata)을 지원하는 생태계 라이브러리 세트가 제공됩니다.

대상 사용자

다변도 생물학적 데이터셋을 일관된 방식으로 정리하고 조작하며 분석이 필요한 공간 오믹스 데이터를 다루는 과학자 및 개발자입니다.

주요 특징

• 공간 오믹스용 유니버설한 스키마 및 직렬화 형식.
• Python, R, JavaScript를 포함한 다국어 지원.
• OME-NGFF 사양과의 통합.
• 인터랙티브 탐색 및 데이터 로딩을 위한 전용 도구를 갖춘 scverse 생태계의 일부.