scverse/rapids-singlecell

해결하는 문제

대규모 단세포 데이터셋 분석 시 발생하는 성능 저하 문제를 해결하기 위해 일반적인 분석 워크플로우를 CPU에서 GPU로 이동하여 계산 속도를 크게 향상시킵니다.

작동 방식

이 라이브러리는 AnnData를 우선시하는 API를 사용하며, CuPy 및 NVIDIA RAPIDS를 활용해 GPU에서 계산을 수행합니다. Scanpy API와 거의 완전히 호환되도록 설계되어, 코드를 크게 수정하지 않고도 워크플로우를 GPU 가속으로 전환할 수 있습니다.

대상 사용자

대규모 데이터셋을 더 효율적으로 처리해야 하는 단세포 분석에 종사하는 연구자 및 데이터 과학자

주요 특징

• GPU 가속: AnnData를 사용하여 일반적인 단세포 워크플로우를 가속화
• 에코시스템 호환성: Scanpy, Squidpy, decoupler, pertpy와 통합되며 호환성 유지
• 간편한 설치: PyPI 및 Conda를 통해 설치 가능