stan-dev/bayesplot
bayesplot R package for plotting Bayesian models
解決する課題
ベイズモデル、特にマルコフ連鎖モンテカルロ法 (MCMC) サンプリングを使用したモデルの結果を分析するための包括的な可視化ツールセットを提供します。モデルの収束診断、事後分布の確認、および事後予測チェックのプロセスを簡素化します。
仕組み
このパッケージは、R用のプロット関数ライブラリとして構築されています。プロットは ggplot オブジェクトとして生成されるため、ggplot2 パッケージを使用してさらにカスタマイズすることが可能です。以下を含む様々な種類の可視化をサポートしています:
- 事後分布の描画プロット
- 視覚的な MCMC 診断(トレースプロットやエネルギー診断など)
- 事後および事前予測チェック (PPC)
- 予測分布の一般的なプロット
対象ユーザー
ベイズモデル(特に Stan を使用するもの)を適合させるユーザーや、標準化された可視化関数セットを必要とするベイズモデリングパッケージの開発者向けに設計されています。
主な特徴
- ggplot2 統合: すべてのプロットは ggplot オブジェクトであり、完全にカスタマイズ可能です。
- MCMC 診断: チェーンの収束とサンプリング効率を確認するための専門的なツールが含まれています。
- 予測チェック: グラフィカルな事後および事前予測チェックのためのツールを提供します。
- Stan エコシステム: 汎用的でありながら、rstan や rstanarm といった Stan ベースのパッケージでの使用に最適化されています。
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