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QuPath - Open-source bioimage analysis for research

何を解決するか

QuPathは、全スライド画像や顕微鏡画像などの大規模な画像を対象としたバイオイメージ分析用のソフトウェアです。生物学的サンプルから定量的データを抽出するために、これらの画像の注釈、表示、分析を可能にするツールを提供しています。

動作方法

このソフトウェアは、明視野および蛍光画像分析のためのツールセットを提供しています。細胞のセグメンテーションや組織マイクロアレイのデアレイリングといった一般的な生物学的イメージングタスクに使用されるアルゴリズムを用いています。また、ピクセルやオブジェクトの分類に向けたインタラクティブな機械学習も組み込んでおり、研究者が定量的病理学を実施できるようにしています。

対象ユーザー

主にバイオイメージ分析および定量的病理学に従事する学術研究者や科学者を対象としています。

特徴

  • オブジェクトおよびピクセル分類のためのインタラクティブな機械学習。
  • 全スライド画像および顕微鏡画像のサポート。
  • 明視野および蛍光ワークフローの両方をサポート。
  • カスタマイズ、バッチ処理、データ調査のためのスクリプト機能。
  • ImageJ などの他のツールとの統合。

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