adalca/neurite

Neural networks toolbox focused on medical image analysis

何を解決するか

Neurite は、医療画像解析に特化したニューラルネットワークツールボックスです。3Dボリュームやフローフィールドなど、バイオメディカルイメージングで一般的な複雑な空間データを扱うための専門的なツールを提供します。

どう動くか

PyTorch(TensorFlow用の安定版も利用可能)に基づいて構築されており、以下のコアモジュールに機能を整理しています:

  • 機能ツール: スムージング、リサンプリング、補間、空間数学用のテンソル操作を提供。
  • モジュール: 再利用可能な状態付きレイヤー、損失関数、前処理ブロックを提供。
  • モデル: 任意の空間次元(1D、2D、3D)で使用可能な事前構築されたネットワークアーキテクチャを含む。
  • プロット: テンソルスライス、ボリューム、フローフィールドの可視化に特化したツールを提供。

対象ユーザー

このライブラリは、医療画像やバイオメディカルセグメンテーションに取り組む研究者や開発者を対象としており、特に畳み込みネットワークにおける非教師学習や解剖学的事前知識の実装に注力している人向けです。

特徴

  • 任意の空間次元(1D、2D、3D)をサポート。
  • 空間数学およびリサンプリング用の専門的なテンソル操作。
  • 医療ボリュームおよびフローフィールド用の専門的なプロットツール。
  • PyTorch や TensorFlow などの主要なディープラーニングフレームワークとの統合。

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