TorchIO-project/torchio

Medical imaging processing for AI applications.

What it solves

TorchIOは、3D医療画像をディープラーニング用に準備するプロセスを簡素化します。大規模な3D医療データセットの効率的な読み込み、前処理、サンプリング、拡張という課題に対処し、標準的なコンピュータビジョンライブラリでは提供されない特殊な変換を可能にします。

How it works

PyTorch用のPythonパッケージとして構築されたTorchIOは、3D医療画像を扱うためのツール群を提供します。ランダムアフィン変換のような一般的なコンピュータビジョン操作と、MRIの磁場不均一やk空間モーションアーティファクトといった実際の医療画像のアーティファクトをシミュレートするドメイン固有の変換の両方を実装しています。また、パッチベースのトレーニングを容易にするQueueシステムを備えており、データのサンプリング効率を向上させます。

Who it’s for

PyTorchを用いて3D医療画像のディープラーニングアプリケーションを構築する研究者や開発者向けです。

Highlights

  • 3D Medical Image Support: 3D医療データの読み込み、前処理、書き出しのための専門ツール。
  • Domain-Specific Augmentation: バイアスフィールド、ゴースト、スパイクなど、MRI特有のアーティファクトをシミュレート。
  • Patch-Based Sampling: トレーニング用画像パッチのサンプリングを最適化するQueueシステムを含む。
  • PyTorch Integration: PyTorchエコシステム内でシームレスに動作するよう設計。