TorchIO-project/torchio

解決する問題

TorchIO は、深層学習用の 3D 医用画像を準備するプロセスを簡素化します。標準的なコンピュータビジョンライブラリでは提供されない特殊な変換を必要とすることが多い、大規模な 3D 医用データセットの効率的な読み取り、前処理、サンプリング、拡張の課題に対処します。

仕組み

PyTorch 用の Python パッケージとして構築された TorchIO は、3D 医用画像を処理するための一連のツールを提供します。データ拡張と前処理のための強度変換と空間変換を実装しています。これには、ランダムアフィン変換などの標準的な視覚操作や、MRI の磁場不均一性や k 空間のモーションアーティファクトなどのドメイン固有のシミュレーションが含まれます。

対象ユーザー

医用画像の深層学習アプリケーションを構築する研究者や開発者、特に PyTorch を使用している人々を対象としています。

ハイライト

• 3D 医用画像サポート: 3D 医用画像の読み取り、前処理、書き込みのための専門ツール。
• ドメイン固有の拡張: ゴースト、スパイク、バイアスフィールドなどの MRI 固有のアーティファクトをシミュレートします。
• パッチベースのトレーニング: トレーニング中の効率的なパッチベースのサンプリングのためのキューシステムを含みます。
• PyTorch 統合: PyTorch ベースの深層学習パイプラインにシームレスに統合されます。