maabuu/posebusters

解決的問題

PoseBusters 提供了一種驗證生成分子構象（例如由基於 AI 的對接方法產生的構象）是否在物理上合理的方法。它解決了 AI 模型可能產生看似正確但物理上無效的構象的問題，無法泛化至新序列。

工作原理

此工具對以 SDF 格式提供的分子構象執行合理性檢查。可評估單一分子、將預測構象與真實晶體結構進行比較，或檢查為特定蛋白質（PDB 格式）生成的配體。

適用對象

需要驗證配體預測三維結構的計算化學家與從事分子對接及基於 AI 的藥物發現的研究人員。

主要亮點

• 生成分子構象的合理性檢查。
• 支援單一分子、蛋白質-配體複合物以及重新對接的配體檢查。
• 基於 CSV 檔案的命令列介面，支援批次處理。
• 基於發表於 Chemical Science 的研究。