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解決的問題

AlphaGenome 解決了預測調控性遺傳變異對基因組功能影響的挑戰。它提供了一種方法，用於理解 DNA 序列變化如何在單鹼基對解析度下影響各種生物學過程。

工作原理

這是一個在 JAX 中實現的統一 DNA 序列模型，可分析長達 100 萬鹼基對的序列。該模型可預測多種基因組資料模態，包括基因表現、剪接模式、染色質特徵和接觸圖譜。使用者可透過 Python API 與模型互動，建立預測、評分變異並執行體外誘變（ISM）。

適用對象

本專案專為研究調控變異效應預測和基因組功能的基因組學研究人員和科學家設計。

主要亮點

• 高解析度：提供單鹼基對解析度的預測。
• 大上下文視窗：能夠分析長達 100 萬鹼基對的 DNA 序列。
• 多模態預測：可預測基因表現、剪接、染色質特徵和接觸圖譜。
• 彈性部署：提供適用於本地使用的研究程式碼實作（需高階 GPU/TPU）以及更易存取的管理式 API。