dptech-corp/Uni-Dock

解決的問題

Uni-Dock 解決了傳統 CPU 基礎分子對接程式處理速度緩慢的問題，這在藥物發現的大規模虛擬篩選中常成為瓶頸。

工作原理

這是一款利用 GPU 硬體進行計算的 GPU 加速分子對接程式。支援多種評分函數，包括 vina、vinardo 和 ad4，能夠高精度預測分子與靶標的結合方式。

適用對象

需要高效完成超大規模虛擬篩選的計算化學與藥物發現領域的研究人員與科學家。

主要亮點

• 在 V100 GPU 上，相比單核心 CPU 的 AutoDock Vina，性能提升超過 2000 倍。
• 支援多種評分函數（vina、vinardo、ad4）。
• 包含 Uni-Dock Tools，一個用於管理輸入輸出的 Python 套件，可簡化虛擬篩選工作流程。
• 配備標準化的基準測試套件，用於性能與準確性的評估。