janosh/pymatviz

解决的问题

pymatviz提供了一个专门用于可视化材料科学数据的工具包。它满足了研究人员轻松生成复杂化学和结构数据（如周期表热图、声子带结构和晶体结构可视化）的高质量交互式绘图的需求。

工作原理

该项目基于Plotly和pymatgen等库构建，提供了一系列Python函数，这些函数接受标准材料科学数据结构（如Structure或Composition对象）并返回可交互的、可发表的图形。它还包含基于anywidget的交互式小部件，允许用户在Jupyter、Marimo或VSCode环境中直接探索结构、轨迹和组成。

适用对象

该工具专为材料科学家、计算化学家以及从事材料信息学的研究人员设计，他们需要进行探索性数据分析（EDA）或可视化高通量材料模拟的结果。

亮点

• 交互式周期表： 创建映射到周期表的热图、直方图和散点图。
• 结构可视化： 内置支持渲染3D晶体结构、布里渊区和X射线衍射（XRD）图谱。
• 笔记本集成： 为Jupyter、Marimo和VSCode提供交互式小部件，支持平移、缩放和旋转。
• 无头导出： 包含将交互式小部件导出为静态图像（PNG/SVG/PDF）或HTML的工具，适用于CI/CD管道或自动化报告。
• 聚类支持： 使用PCA、t-SNE和UMAP等降维技术可视化组成关系的工具。