TorchIO-project/torchio
Medical imaging processing for AI applications.
What it solves
TorchIO 简化了为深度学习准备 3D 医疗图像的过程。它解决了高效读取、预处理、采样和增强大型 3D 医疗数据集的挑战,这些数据集通常需要标准计算机视觉库无法提供的专门转换。
How it works
作为 PyTorch 的 Python 包构建,TorchIO 提供了一套处理 3D 医疗图像的工具。它实现了通用的计算机视觉操作(如随机仿射变换)以及模拟真实医学成像伪影的领域特定变换,例如 MRI 磁场不均匀和 k 空间运动伪影。它还包括一个 Queue 系统,以促进基于补丁的训练,从而实现更高效的数据采样。
Who it’s for
使用 PyTorch 构建 3D 医疗影像深度学习应用的研究人员和开发者。
Highlights
- 3D Medical Image Support: 专用于读取、预处理和写入 3D 医疗数据的工具。
- Domain-Specific Augmentation: 模拟 MRI 特有的伪影,如偏置场、鬼影和尖峰。
- Patch-Based Sampling: 包含 Queue 系统,以优化训练时图像补丁的采样。
- PyTorch Integration: 设计上与 PyTorch 生态系统无缝衔接。