JoHof/lungmask

Automated lung segmentation in CT

解决的问题

提供CT扫描中肺部的自动分割,特别设计用于处理肿瘤、胸腔积液和严重纤维化等严重病理,这些情况常导致标准分割工具失效。

工作原理

该项目使用训练好的U-net模型处理CT图像。根据目标提供四种不同模型:

  • U-net(R231):通用模型,可分离左右肺并包含密集的病灶区域。
  • U-net(LTRCLobes):专用模型,用于分割单个肺叶。
  • U-net(LTRCLobes_R231):混合方法,将肺叶特异性模型与通用模型融合,以填补缺失区域(假阴性)。
  • U-net(R231CovidWeb):通过COVID-19数据增强的版本,能更好地处理来自网络的裁剪或非标准图像。

适用人群

需要对肺部CT数据进行可靠自动掩码的医疗研究人员和临床医生,用于肺体积或特定肺叶分析。

亮点

  • 病灶鲁棒性:能够将肿瘤和胸腔积液包含在分割结果中。
  • 灵活输入:支持DICOM系列、ITK格式和Numpy数组。
  • GPU加速:支持CUDA,显著加快推理速度(每体积数秒 vs. 数分钟)。
  • 多模态支持:提供简单的左右肺分离和详细的五叶分割两种模式。

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