EddyRivasLab/hmmer
HMMER: biological sequence analysis using profile HMMs
解决的问题
它提供了一种方法，可以使用单个序列或多重序列比对作为查询，在生物序列数据库中搜索同源序列。
工作原理
它实现了称为「谱隐马尔可夫模型」（profile HMM）的技术来执行这些搜索。
适用人群
专为从事蛋白质家族域数据库和大规模注释流水线的研究人员和开发者设计。
主要亮点
- 使用谱隐马尔可夫模型（profile HMM）。
- 支持基于单个序列或多重序列比对的查询。
- 已集成到多个蛋白质家族域数据库和 InterPro 联盟中。
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