10XGenomics/cellranger
10x Genomics Single Cell Analysis
解决的问题
它提供了一种标准化的方法，用于处理来自 10x Genomics Chromium 单细胞平台的原始数据，将原始测序读取数据转换为基因计数和转录本序列等可用的生物数据。
工作原理
它使用一组分析管道执行多个关键任务：样本去多重化、条形码处理，以及单细胞 3' 和 5' 表达的基因计数。它还支持 V(D)J 转录本序列组装和注释，以及 Feature Barcode 分析。
适用人群
使用 10x Genomics Chromium 平台生成的单细胞测序数据的研究人员和科学家。
主要亮点
- 单细胞基因计数的标准化管道
- 支持 V(D)J 转录本序列组装
- 支持 Feature Barcode 分析
- 支持 3' 和 5' 基因计数
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