Anthropic 生命科学:Claude 发现新型阵列相关逆转录酶 (ART)
Claude 识别出新型 ART 酶系统
Anthropic 宣布发现了一种名为阵列相关逆转录酶 (ART) 的新型酶系统,这是通过 Claude 智能体对 DNA 序列数据库进行自主分析所识别出的。该系统主要存在于噬菌体中,由一个逆转录酶 (RT)、一个相邻的配对基因以及一长串均匀间隔的 DNA 重复序列组成。这种结构模式让人联想到 CRISPR 阵列,后者使 CRISPR-Cas 系统具有可编程性;早期实验表明,ART 阵列被表达为一组独特的短 RNA,这暗示其可能存在类似的编程机制。
虽然逆转录酶在之前的研究中已被识别,但 Claude 是第一个识别出该系统核心特征的:即相关的非编码 DNA 序列阵列以及一个功能未知的额外辅助蛋白。
AI 驱动的生物发现工作流程
Anthropic 在湾区建立了一个专门的生命科学研究小组和实验室,以系统化生物发现过程。该工作流程将 AI 智能体与人类实验室验证整合在一个多阶段的流水线中:
- 广泛调查:Claude 智能体在海量 DNA 数据库中搜索特定的蛋白质家族(例如 RT)。在此次专项活动中,智能体收集了超过 200,000 个 RT。
- 候选筛选:AI 将候选池缩小到有潜力的对象。Claude 将 200,000 个 RT 减少到 3,500 个候选系统,并进一步筛选出 20 个高优先级候选对象。
- 假设生成:针对最终候选对象,Claude 生成人类可读的报告,提出功能假设并提供支持证据。
- 人工审查与实验室测试:人类科学家审查 AI 的报告。通过审查的候选对象会在实验室菌株中进行表达,并进行生化和结构表征。
此过程使用 Claude Science 和 Claude Code 执行,有时由自定义工具协调以并行运行多个会话。对于 ART 的发现,大约 950 个智能体在 21 小时内使用了 2.1 亿个 token 来识别该模式。
专家验证与技术现状
CRISPR 基因编辑先驱、麻省理工学院和博德研究所教授张锋 (Feng Zhang) 审阅了该研究的预印本,并表示:
"这是一个令人兴奋的例子,展示了 AI 智能体如何为生物发现做出贡献。识别出与逆转录酶相关的 RNA 重复阵列确实非常引人入胜,值得进一步研究。" — @handle
Anthropic 的实验室在生物安全风险等级 1 和 2 (BSL-1 和 BSL-2) 下运行,不处理人类病原体。所有物理实验室工作均由人类科学家执行。
社区观点与技术批评
公告发布后,Hacker News 上的科学和技术社区针对该发现的性质和方法论提出了几点批评意见:
关于“发现”的本质
一些批评者认为,由于底层的逆转录酶早已为人所知,AI 发现的并非一种新酶,而是一种新的基因组排列。一位用户指出,该发现本质上是对已知 RT 周围一种先前未描述的基因组排列的识别,这在基因组挖掘中是一项常见任务。
严谨性与发表
几位评论者质疑为什么这些发现是以营销博客文章和预印本的形式发布,而不是通过《Nature》或《Science》等同行评审期刊。批评者认为,缺乏传统的同行评审过程可能会掩盖对该酶系统功能理解的严谨性不足。
人类与 AI 的归属权
关于“Claude 发现”的措辞存在重大争议。批评者认为,这一发现是人类设计的工具和专家生物学家团队验证数据的结果,将成功完全归功于 AI 是一种营销叙事,而非科学事实。
安全与伦理
人们对 AI 加速制造靶向病毒的潜力,或在没有独立监督的情况下进行 AI 驱动的生物工程所带来的普遍危险表示担忧。另一些人则担心 AI 实验室通过利用研究人员使用其工具所贡献的数据,可能会“抢先”发表学术研究成果。
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