GPT-Rosalind 更新:增强生命科学能力和研究工具
GPT-Rosalind 更新:增强生命科学能力和研究工具
OpenAI 已更新 GPT-Rosalind,将 GPT-5.5 的 agentic 能力与药物化学、基因组学和湿实验故障排除的专业智能相结合,以服务于企业级生命科学研究。
生命科学研究中的性能提升
GPT-Rosalind 在涉及定量生物学、复杂药物化学查询和湿实验故障排除的研究任务上展现出广泛的性能提升。为了衡量这些提升,OpenAI 开发了 LifeSciBench,一个由外部专家评判的基准,用于评估六个关键领域的端到端科学工作流程:
- 证据处理
- 分析
- 设计与优化
- 科学推理
- 验证与运营
- 翻译与传播
药物化学
使用 MedChemBench 评估——该评估涵盖多模态化学结构理解、结构-活性关系(SAR)、ADME 预测(吸收、分布、代谢、排泄)、先导优化和逆向合成——GPT-Rosalind 以 27.5% 的得分超过了 GPT-5.5 的 25.1%,同时使用了 7.2% 更少的 token。
基因组学和定量生物学
在 GeneBench 上,这是一个专注于蛋白质组学、表观基因组学、空间转录组学和功能基因组学的长周期、端到端分析的 agentic 评估,GPT-Rosalind 达到了 21.6% 的准确率(而 GPT-5.5 为 20.4%),同时使用了 31% 更少的 token。
湿实验协助
OpenAI 推出了 LabWorkBench 来测试模型在真实湿实验方案中将扰动与实验结果关联的能力。GPT-Rosalind 得分 63.2%,显著高于 GPT-5.5 的 55.8%,同时将 token 使用量降低了 5.3%。
集成的研究工作流程和工具
为了从模型推理过渡到执行的工作流程,OpenAI 通过 Codex 发布了两个可访问的插件:
- 生命科学研究插件: 提供有来源的证据检索和生物学解释。
- 生命科学 NGS 分析插件: 使能生物信息学执行,例如将处理过的 ctDNA 记录转换为交互式笔记本,或将 10x 风格的矩阵束转换为经过 QC 过滤的单细胞制品和 UMAP。
这些插件得到了新交互式查看器的支持,用于生物本机文件类型,包括序列、比对和结构查看器,使研究人员能够直接在工作区内检查证据(例如突变残基或抑制剂结合口袋)。
部署和企业访问
GPT-Rosalind 通过受信任的访问部署结构,向全球符合条件的组织提供研究预览版。此访问仅限于开展合法科学研究、具有明确公共利益、强大治理和企业级安全的组织。
作为此推出的一部分,OpenAI 正与 Novo Nordisk 合作,以扩大医学研究规模,利用 GPT-Rosalind 将文献、基因组学、转录组学和实验结果中的证据联系起来,以加速药物发现。
"生命科学研究是复杂的、数据丰富的且跨学科的。为了为研究人员提供有意义的价值,先进的 AI 模型必须建立在可信的科学数据之上,连接到经过验证的工具,并融入研究人员每天使用的真实世界工作流程。" — Mishal Patel,集团副总裁,AI 与数字创新,研发 - Novo Nordisk
未来方向
OpenAI 打算继续提升 GPT-Rosalind 的生物推理能力以及对长周期研究工作流程的支持。该模型的能力正被应用于高影响力的公共利益工作,包括转化医学、公共卫生和通过 Rosalind Biodefense 倡议的生物防御。