dptech-corp/Uni-Dock

해결하는 문제

Uni-Dock는 약물 발견을 위한 대규모 가상 스크리닝에서 버퍼링이 되는 기존 CPU 기반 분자 도킹 프로그램의 느린 처리 속도를 해결합니다.

작동 방식

GPU 하드웨어를 활용하여 계산을 수행하는 GPU 가속 분자 도킹 프로그램입니다. vina, vinardo, ad4 등 여러 스코어링 함수를 지원하여 분자가 타겟에 결합하는 방식을 높은 정확도로 예측할 수 있습니다.

대상 사용자

초대규모 가상 스크리닝을 효율적으로 수행해야 하는 계산 화학 및 약물 발견 분야의 연구자 및 과학자들입니다.

주요 특징

• V100 GPU에서 단일 코어 CPU AutoDock Vina 대비 2000배 이상의 속도 향상을 달성하는 GPU 가속 성능.
• 여러 스코어링 함수(vina, vinardo, ad4) 지원.
• 가상 스크리닝 워크플로우를 간소화하기 위한 입력/출력 관리를 가능하게 하는 Uni-Dock Tools(파이썬 패키지) 포함.
• 성능 및 정확도 평가를 위한 표준화된 벤치마크 세트 제공.