MouseLand/Kilosort

해결하는 문제

Kilosort4는 대규모 신경 기록에서 개별 뉴런의 전기적 활동(스파이크)을 식별하고 분리하는 과정인 '스파이크 소팅(spike sorting)' 문제를 해결하기 위해 설계되었습니다. 이를 통해 연구자들은 고밀도 전극 프로브 기록에서 어떤 스파이크가 특정 뉴런에 속하는지 구분할 수 있습니다.

작동 방식

이 소프트웨어는 GPU 가속 파이프라인을 사용하여 바이너리 데이터 파일과 프로브 구성을 처리합니다. 스파이크를 식별하고 파형에 따라 유닛으로 클러스터링합니다. 이 과정은 매개변수 조정을 위한 GUI와 통합되어 있으며, 결과 정밀 분석을 위한 수동 클러스터링 인터페이스인 Phy와 호환되는 형식으로 결과를 출력합니다.

대상 사용자

주로 고밀도 신경 기록을 다루며, 원시 전기 데이터에서 개별 뉴런 활동을 분리하는 과정을 자동화해야 하는 신경과학자 및 연구자를 위한 도구입니다.

주요 특징

• GPU 가속: 고성능 처리를 위해 최소 8GB의 GPU RAM(12GB 이상 권장)이 필요합니다.
• 통합 GUI: 데이터 로드 및 소팅 파이프라인 실행을 위한 사용자 친화적인 인터페이스를 제공합니다.
• Phy 통합: 추정 오염률을 기반으로 '양호한' 유닛을 자동으로 설정하고, Phy에서 수동으로 정밀 분석할 수 있도록 데이터를 내보냅니다.
• 크로스 플랫폼 지원: Windows 10, 11 및 Ubuntu 20.04에서 완벽하게 테스트되었습니다.