10XGenomics/cellranger

해결하는 문제

10x Genomics Chromium 단세포 플랫폼에서 생성된 원시 데이터를 표준화된 방식으로 처리하여 원시 시퀀싱 읽기 데이터를 유용한 생물학적 데이터(예: 유전자 수, 전사 서열)로 변환합니다.

작동 방식

샘플의 디멀티플렉싱, 바코드 처리, 3' 및 5' 발현을 위한 유전자 카운팅과 같은 주요 작업을 수행하는 분석 파이프라인 세트를 사용합니다. 또한 V(D)J 전사 서열 조립 및 주석, Feature Barcode 분석도 처리합니다.

대상 사용자

10x Genomics Chromium 플랫폼에서 생성된 단세포 시퀀싱 데이터를 다루는 연구자 및 과학자입니다.

주요 특징

• 단세포 유전자 카운팅을 위한 표준화된 파이프라인
• V(D)J 전사 서열 조립 지원
• Feature Barcode 분석 지원
• 3' 및 5' 유전자 카운팅 모두 지원