anthropics/life-sciences

Repo for the Claude Code Marketplace to use with the Claude for Life Sciences Launch. This will continue to host the marketplace.json long-term, but not the actual MCP servers.

解決する課題

このプロジェクトは、Claude Code 用の専門的なプラグインマーケットプレイスを提供し、生命科学の研究者が専門的な研究ツール、学術データベース、バイオインフォマティクスワークフローを AI アシスタントに直接統合できるようにします。汎用 LLM と、生物学研究で使用される高度に専門化されたデータソースおよび分析ツールの間のギャップを埋めます。

仕組み

Model Context Protocol (MCP) を利用して、Claude Code を外部サービスやローカルツールに接続します。主に 2 種類の拡張機能を提供します:

  • MCP サーバー:PubMed、BioRender、Synapse などのリモートサービスへのブリッジとして機能し、AI が文献検索、データ管理プラットフォームへのアクセス、科学イラストツールとの対話を行えるようにします。
  • スキル:これらはドメイン固有のワークフローであり、シングルセル RNA-seq データの自動品質管理や、Nextflow を介した nf-core バイオインフォマティクスパイプラインの実行などが含まれます。

対象者

  • 実験系科学者:深いバイオインフォマティクスの訓練なしに、大規模なオミクス解析を実行する必要がある方。
  • 生命科学研究者:文献検索、データ管理、プロジェクトのアイデア創出を合理化したい方。
  • バイオインフォマティシャン:scvi-tools のような深層学習ツールキットを AI 支援ワークフローに統合したい方。

ハイライト

  • 学術統合:エビデンスに基づく研究のために、PubMed、Wiley Scholar Gateway、Consensus に直接アクセス。
  • バイオインフォマティクスパイプライン:nf-core パイプライン(rnaseq、sarek、atacseq)と、深層学習オミクス解析のための scvi-tools をサポート。
  • データ標準化:機器データを Allotrope Simple Model (ASM) 形式に変換するツール。
  • 戦略的計画:確立された方法論に基づく科学的課題の選択とリスク評価のフレームワーク。
  • 業界ツール:10x Genomics Cloud、Cortellis、AdisInsight などの専門プラットフォームへの接続。

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