EddyRivasLab/hmmer
HMMER: biological sequence analysis using profile HMMs
何を解決するか
単一の配列または複数配列アラインメントをクエリとして使用して、生物学的配列データベースから相同配列を検索する方法を提供します。
動作方法
この検索を実行するために「プロファイル隠れマルコフモデル」(profile HMM) と呼ばれる技術を実装しています。
対象ユーザー
タンパク質ファミリー領域データベースや大規模なアノテーションパイプラインの開発に従事する研究者や開発者向けに設計されています。
特徴
- プロファイル隠れマルコフモデル (profile HMM) を使用。
- 単一配列または複数配列アラインメントに基づくクエリをサポート。
- 複数のタンパク質ファミリー領域データベースおよび InterPro コンソーシアムに統合されています。
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