GPT-Rosalind アップデート:ライフサイエンス機能と研究ツールの強化
GPT-Rosalind アップデート:ライフサイエンス機能と研究ツールの強化
OpenAIは、エンタープライズ規模のライフサイエンス研究に特化して設計されたモデルシリーズである GPT-Rosalind のモデルアップデートをリリースしました。このアップデートでは、GPT-5.5 のエージェント的コーディングおよびツール使用機能と、ゲノミクスや創薬化学を含むコアな創薬ドメインにおける強化されたインテリジェンスを統合し、分析、設計、実験ワークフロー全体におけるパフォーマンスを向上させています。
ライフサイエンス研究におけるパフォーマンスの向上
GPT-Rosalind は、定量生物学、複雑な創薬化学のクエリ、およびウェットラボのトラブルシューティングを含む研究タスクにおいて、広範なパフォーマンスの向上を示しています。これらの向上を測定するために、OpenAI は LifeSciBench を開発しました。これは外部の専門家によって判定されるベンチマークであり、以下の6つの主要領域にわたるエンドツーエンドの科学的ワークフローを評価します:
- エビデンスの取り扱い
- 分析
- 設計および最適化
- 科学的推論
- 検証およびオペレーション
- 翻訳およびコミュニケーション
創薬化学
マルチモーダルな化学構造の理解、構造活性相関 (SAR)、ADME予測(吸収、分布、代謝、排泄)、リード最適化、および逆合成合成をカバーする MedChemBench 評価において、GPT-Rosalind は 27.5% のスコアを記録し、GPT-5.5 の 25.1% を上回りました。その際、トークン使用量は 7.2% 削減されました。
ゲノミクスおよび定量生物学
プロテオミクス、エピゲノミクス、空間トランスクリプトミクス、および機能ゲノミクスにおける長期的なエンドツーエンドの分析に焦点を当てたエージェント的評価である GeneBench において、GPT-Rosalind は 21.6% の精度(GPT-5.5 の 20.4% に対して)を達成し、トークン使用量を 31% 削減しました。
ウェットラボ支援
OpenAI は、実際のウェットラボのプロトコルにおいて、摂動を実験結果に結びつけるモデルの能力をテストするために LabWorkBench を導入しました。GPT-Rosalind は 63.2% のスコアを獲得し、GPT-5.5 の 55.8% を大幅に上回ると同時に、トークン使用量を 5.3% 削減しました。
統合された研究ワークフローとツール群
モデルの推論から実行可能なワークフローへと移行するために、OpenAI は Codex を通じてアクセス可能な2つのプラグインをリリースしました:
- Life Sciences Research Plugin: ソース付きのエビデンス検索と生物学的解釈を提供します。
- Life Sciences NGS Analysis Plugin: プロセス済みの ctDNA レコードをインタラクティブなノートブックに変換したり、10x スタイルのマトリックスバンドルを QC フィルタリング済みのシングルセルアーティファクトや UMAP に変換したりするなど、バイオインフォマティクスの実行を可能にします。
これらのプラグインは、配列、アライメント、構造ビューアを含む、生物学的にネイティブなファイル形式のための新しいインタラクティブビューアによってサポートされており、研究者はワークスペース内で直接エビデンス(変異残基や阻害剤結合ポケットなど)を検査できます。
デプロイメントとエンタープライズアクセス
GPT-Rosalind は、信頼できるアクセスデプロイメント構造を通じて、世界中の適格な組織向けにリサーチプレビューとして提供されています。このアクセスは、明確な公共の利益、強力なガバナンス、およびエンタープライズグレードのセキュリティを備えた、正当な科学研究を行う組織に限定されています。
この展開の一環として、OpenAI は Novo Nordisk と提携して医学研究をスケールアップしており、GPT-Rosalind を活用して文献、ゲノミクス、トランスクリプトミクス、および実験結果にわたるエビデンスを接続し、創薬を加速させています。
「ライフサイエンス研究は複雑で、データが豊富で、学際的です。研究者に意味のある価値を提供するためには、高度な AI モデルは信頼できる科学データに根ざし、検証済みのツールと接続され、研究者が毎日使用する実世界のワークフローに統合されていなければなりません。」 — Mishal Patel, Group Vice President, AI & Digital Innovation, R&D - Novo Nordisk
今後の方向性
OpenAI は、GPT-Rosalind の生物学的推論と長期的な研究ワークフローへのサポートの継続的な改善を意図しています。モデルの機能は、Rosalind Biodefense イニシアチブを通じて、トランスレーショナルメディシン、公衆衛生、生物防御を含む、社会的インパクトの大きい公共利益のための業務に適用されています。